Szpital Specjalistyczny w Zabrzu współpracuje w zakresie naukowo-badawczym z następującymi jednostkami Śląskiego Uniwersytetu Medycznego:
Katedra Chorób Wewnętrznych, Dermatologii i Alergologii Przedmiotem badań są chorzy z alergicznym nieżytem nosa i/lub z astmą oskrzelową. Wspólnie oceniane są wyniki leczenia pacjentów. Publikowane są w tym zakresie prace w czasopismach medycznych.
Katedra Chorób Wewnętrznych, Nefrologii i Diabetologii oraz Katedra i Zakład Biologii Medycznej i Molekularnej Współpraca w zakresie badań uwarunkowań genetycznych u chorych z nowotworami krtani oraz roli wirusa HPV w występowaniu nowotworów głowy i szyi
Katedra i Klinika Chorób Płuc i Gruźlicy Współpraca w zakresie diagnozowania i leczenia chorych ze zwężeniami dróg oddechowych
II Katedrą i Oddziałem Klinicznym Kardiologii Współpraca w zakresie diagnostyki i leczenia zespołu bezdechów sennych oraz ich wpływu na schorzenia kardiologiczne
Katedra i Zakład Biochemii Badania oceny wskaźników oksydoredukcyjnych u chorych z guzami ślinianek oraz wyników audiologicznych u chorych narażonych na ołów
Katedra i Zakład Patomorfologii Współpraca w zakresie badań spektrofotometrycznych w guzach ślinianek przyusznych
Katedra Anestezjologii i Intensywnej Terapii Współpraca w ramach znieczuleń met – Jet Ventilation w schorzeniach górnych dróg oddechowych